Первое упоминание о роде Juniperus в Аптекарском огороде встречается в каталоге 1793 г.: это 2 вида, из которых один — местный вид J. communis L. (1793—1926, до 1935— 1949, 1961—1980, ?—2002), довольно плохо переносящий городские условия жизни. Впоследствии было испытано более десятка его разновидностей и форм, из которых более полувека растут в парке J. с. var. depressa Pursh (1950—2005) и J. с. f. hibernica Gordon (до 1950—2005). J. с. var. suecica (Mill.) Aiton (= J. suecica Mill.) (пo Fajon, это J. communis var. communis) испытывался в 1874—1886 и 1891—1898 гг., a J. с. var. saxatilis Pall.— в 1969, 1988—1997 гг. В конце XX в. в коллекции появились культивары 'Depressa Aurea' (передан из оранжерей — 1978—1981), 'Hibernica Aurea' (1995—2002), 'Compressa' (1997—1999), 'Oblonga Pendula' (?—2002). 

Вторым видом, упомянутым в каталоге 1793 г., был J. sabina L. (= J. s. var. cupressifolia Aiton, J. s. var. tamariscifolia Aiton) (1793—1914, 1939—1941, 1949—1981, 1988—2005). J. s. f. variegata (West.) Beissn. выращивался в открытом грунте в 1858—1881, 1897— 1914, 1990—2002, но, возможно, появился до 1845 г.

С 1816 г. в каталогах стали упоминаться J. sibirica Burgsd. (= J. nаnа Willd.) (по Farjon, это J. communis var. saxatilis) (1816—1858, 1870—1923, до 1940—2005) и J. virginiana L. (1816—1845, 1891—1898, 1913, до 1937—2005). Две формы последнего вида были испытаны позднее: f. glauca (Carriere) Beissn. в 1958—1974 г. и 'Skyrocket' — в 1997—2005 гг.

Первое упоминание Ф. Фишера о J. pseudosabina Fisch. et Меу. относится к 1852 г., однако, возможно, вида в коллекции в это время еще не было, ибо в 1883 г. Э. Регель пишет, что вид «недавно введен А. Регелем из Туркестана». В генеральных каталогах он числится с 1879 г. как полученный от Б. А. Федченко и в 1885 г. повторно от А. Регеля (1879—1905, 1912— 1916,1939—1945,1997).

В конце XIX в. коллекция пополнилась J. horizontalis Moench (= J. prostrata Pers.) (1881—1898, 1940—?, 1963—2005) и J. chinensis L. (= J. thunbergii Hook, et Am.) (1892—1898, 1962— 1963, 1988—2005). Культивары этих видов приведены в 2002 г.: J. h. 'Bar Harbour' (1997—2002) и J. ch. 'Keteleeri' (?—2002).
Испытание видов можжевельника в XX в. принимает более внушительные размеры: 16 новых для коллекции видов, повторные испытания выпавших старых видов и попытка пополнить коллекцию за счет культиваров, привезенных черенками из Гамбурга, Сочи, Чехословакии, Саласпилса и др. Испытание новых видов началось с J. davurica Pall, (по Farjon, это J. sabina L. var. davurica (Pall.) Farjon) (1915—1936, 1985—2005). Этот вид был испытан Э. Регелем в «Помологическом саду», вероятно, в 70-х гг. XIX в., ибо в 1870 г. он пишет, что нигде в садах Петербурга этого вида не встречал, а в 1883 г. характеризует его как «выносливый». В коллекцию нашего Сада можжевельник даурский поступил в 1915 г. от Я. К. Кессельринга из «Помологического сада». 

В 1940 г. в каталогах упоминается единожды вид из Китая J. squamata Buch.Ham. ex D. Don, однако его дальнейшая судьба неизвестна: вероятно, вымерз в первую зиму. Но с 1985 по 2002 г. выращивается J. s. var. meyeri Render. Несколько попыток испытать один из самых декоративных можжевельников — J. excelsa Bieb., растущего в природе в Крыму, на севере Западного Закавказья, в Малой Азии, заканчивались неудачей: 1949—1950, 1956—1958, 1958— 1971.

В 50-х гг. XX в. среди испытанных видов были виды из горных районов Средней Азии и Средиземноморья. Часть из них быстро выпадала из коллекции и неоднократно восстанавливалась: J. turkestanica Коm. (по Farjon, это J. pseudosabina) (1953—1980, 1989—1991), J. oxycedrus L. (1955—1958, 1990— 1997), J. seravschanica Kom. (1955—1958, 1962—1980, 1986— 1996), J. oblonga Bieb. (1956—2005) и J. о. f. depressa (1966— 1974), J. semiglobosa Regel (1959—1971, 1996—2002).

С 1961 пo 1970 г. в коллекции появились еще 3 новых вида: J. rigida Siebold et Zucc. (1961—1987), J. scopulorum Sarg. (1963—2005), J. pygmaea С Koch (до 1970—1988). J. rigida и J. pygmaea погибли в аномально суровую зиму 1986/87 г. Из видов, упоминаемых в каталогах в конце XX в., только J. sargentii (A. Henry) Takeda ex Koidz. выращивается в Саду более 10 лет (1990—2005), остальные виды появлялись эпизодически:  J. monosperma   (Engelm.)   Sarg.   (1988),  J. conferta  Parl. (1996—1998), J. hemisphaerica J. et С Presl. (1997), J. foetidissima Willd. (?—2002).

Как отмечает В. П. Малеев в издании «Деревья и кустарники СССР» (1949), J. procumbens (Siebold ex Endl.) Miq. был введен в С.-Петербург в 1864 г. К.И. Максимовичем. Однако в каталогах нет никаких подтверждений тому, что это относилось к открытому грунту. В 2002 г. этот вид вновь упомянут Г. А. Фирсовым, как существующий в коллекции. Им же в каталоге 2002 г. приводятся культивары J. x media Van Melle: 'Pfitzeriana', 'Pfitzeriana Aurea', 'Plumosa Aurea', а также J. sabina 'Erecta'.       
              
Самые старые экземпляры можжевельников в парке: J. communis f. hibernica (до 1950—2005) —уч. 103, J. horizontalis (1963—2005)—уч. 101, J. virginiana (1963—2005)—уч. 66, J. scopulorum (1963—2005) —уч. 138.
Среди видов, введенных впервые в культуру открытого грунта С.-Петербургским садом, согласно В. И. Липскому и К. К. Мейсснеру (1913/1915), J. pseudosabina — 1852 г. (по Регеля — 1900 г.). Может быть, к нему мы имеем право добавить J. seravschanica (1955 г.) и J. turkestanica (1953 г.).